En 2014 la Universidad de Alcalá fue reconocida también como la Universidad pública más transparente de España, según el Grupo de Investigación TRABUCOM (Transparencia, Buena Gobernanza y Comunicación) de la Universidad Complutense de Madrid.

La UAH es una de las cinco universidades que cumple todos los requisitos establecidos por la Fundación (26 indicadores), obteniendo la máxima valoración posible por segundo año consecutivo. El informe destaca el esfuerzo de las universidades que encabezan la clasificación por ‘difundir y publicar la información relevante de la organización, haciéndola visible y accesible a todos los grupos de interés de manera íntegra y actualizada’,

La Universidad de Alcalá fue pionera al poner en marcha en abril de 2013 un Portal de Transparencia, que sirvió luego de inspiración a otras webs y fue calificado por el director de la Fundación Compromiso y Transparencia como un 'esfuerzo serio por impulsar la transparencia en la universidad’, en declaraciones realizadas al diario ‘El Mundo’ dentro del reportaje titulado ‘Las reformas ejemplares de Alcalá’. El Portal de Transparencia de la UAH ha recibido varias distinciones desde su nacimiento: en 2013 un comité de expertos pertenecientes a la Red Telescopi -Red Internacional de Observatorios de Buenas Prácticas de Dirección Estratégica Universitaria en Latinoamérica y Europa- le otorgó una acreditación internacional por buenas prácticas en gestión universitaria y la Fundación Compromiso y Transparencia seleccionó el Portal de Transparencia (junto con los de las Universidades de Cantabria, Málaga y Las Palmas) entre las 10 mejores iniciativas en transparencia y buen gobierno del año 2013.

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